Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bhlhb9Q6PB60 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Bhlhb9Q6PB60 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bhlhb9Q6PB60 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bhlhb9Q6PB60 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bhlhb9Q6PB60 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bhlhb9Q6PB60 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bhlhb9Q6PB60 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bhlhb9Q6PB60 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bhlhb9Q6PB60 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bhlhb9Q6PB60 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bhlhb9Q6PB60 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bhlhb9Q6PB60 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bhlhb9Q6PB60 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bhlhb9Q6PB60 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bhlhb9Q6PB60 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bhlhb9Q6PB60 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bhlhb9Q6PB60 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bhlhb9Q6PB60 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bhlhb9Q6PB60 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bhlhb9Q6PB60 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bhlhb9Q6PB60 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bhlhb9Q6PB60 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bhlhb9Q6PB60 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bhlhb9Q6PB60 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bhlhb9Q6PB60 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bhlhb9Q6PB60 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bhlhb9Q6PB60 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bhlhb9Q6PB60 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bhlhb9Q6PB60 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhb9Q6PB60 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhb9Q6PB60 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhb9Q6PB60 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhb9Q6PB60 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhb9Q6PB60 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhb9Q6PB60 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Bhlhb9Q6PB60 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Bhlhb9Q6PB60 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Bhlhb9Q6PB60 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Bhlhb9Q6PB60 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bhlhb9Q6PB60 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhb9Q6PB60 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms