Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fhod1Q6P9Q4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fhod1Q6P9Q4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fhod1Q6P9Q4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fhod1Q6P9Q4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fhod1Q6P9Q4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fhod1Q6P9Q4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fhod1Q6P9Q4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fhod1Q6P9Q4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fhod1Q6P9Q4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fhod1Q6P9Q4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fhod1Q6P9Q4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fhod1Q6P9Q4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fhod1Q6P9Q4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fhod1Q6P9Q4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fhod1Q6P9Q4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fhod1Q6P9Q4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fhod1Q6P9Q4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fhod1Q6P9Q4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fhod1Q6P9Q4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fhod1Q6P9Q4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fhod1Q6P9Q4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fhod1Q6P9Q4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Fhod1Q6P9Q4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fhod1Q6P9Q4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fhod1Q6P9Q4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fhod1Q6P9Q4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Fhod1Q6P9Q4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fhod1Q6P9Q4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fhod1Q6P9Q4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fhod1Q6P9Q4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fhod1Q6P9Q4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fhod1Q6P9Q4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fhod1Q6P9Q4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fhod1Q6P9Q4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fhod1Q6P9Q4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fhod1Q6P9Q4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms