Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slf2Q6P9P0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slf2Q6P9P0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slf2Q6P9P0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slf2Q6P9P0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slf2Q6P9P0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slf2Q6P9P0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slf2Q6P9P0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slf2Q6P9P0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slf2Q6P9P0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slf2Q6P9P0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slf2Q6P9P0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slf2Q6P9P0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slf2Q6P9P0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slf2Q6P9P0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slf2Q6P9P0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slf2Q6P9P0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Slf2Q6P9P0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slf2Q6P9P0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slf2Q6P9P0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slf2Q6P9P0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slf2Q6P9P0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slf2Q6P9P0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slf2Q6P9P0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slf2Q6P9P0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slf2Q6P9P0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slf2Q6P9P0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slf2Q6P9P0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slf2Q6P9P0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slf2Q6P9P0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slf2Q6P9P0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slf2Q6P9P0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slf2Q6P9P0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slf2Q6P9P0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slf2Q6P9P0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slf2Q6P9P0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slf2Q6P9P0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slf2Q6P9P0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slf2Q6P9P0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slf2Q6P9P0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slf2Q6P9P0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slf2Q6P9P0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slf2Q6P9P0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Slf2Q6P9P0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slf2Q6P9P0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slf2Q6P9P0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slf2Q6P9P0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slf2Q6P9P0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Slf2Q6P9P0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Slf2Q6P9P0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Slf2Q6P9P0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slf2Q6P9P0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slf2Q6P9P0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slf2Q6P9P0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slf2Q6P9P0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slf2Q6P9P0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slf2Q6P9P0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slf2Q6P9P0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slf2Q6P9P0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slf2Q6P9P0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slf2Q6P9P0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slf2Q6P9P0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slf2Q6P9P0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slf2Q6P9P0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slf2Q6P9P0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slf2Q6P9P0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slf2Q6P9P0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slf2Q6P9P0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slf2Q6P9P0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slf2Q6P9P0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slf2Q6P9P0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slf2Q6P9P0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slf2Q6P9P0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slf2Q6P9P0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slf2Q6P9P0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Slf2Q6P9P0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slf2Q6P9P0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Slf2Q6P9P0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Slf2Q6P9P0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Slf2Q6P9P0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Slf2Q6P9P0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slf2Q6P9P0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slf2Q6P9P0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Slf2Q6P9P0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slf2Q6P9P0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slf2Q6P9P0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slf2Q6P9P0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slf2Q6P9P0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slf2Q6P9P0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slf2Q6P9P0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slf2Q6P9P0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slf2Q6P9P0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Slf2Q6P9P0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slf2Q6P9P0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slf2Q6P9P0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Slf2Q6P9P0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Slf2Q6P9P0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Slf2Q6P9P0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Slf2Q6P9P0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slf2Q6P9P0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms