Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
LMOD2Q6P5Q4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LMOD2Q6P5Q4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LMOD2Q6P5Q4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LMOD2Q6P5Q4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LMOD2Q6P5Q4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LMOD2Q6P5Q4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
LMOD2Q6P5Q4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LMOD2Q6P5Q4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LMOD2Q6P5Q4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
LMOD2Q6P5Q4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
LMOD2Q6P5Q4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LMOD2Q6P5Q4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LMOD2Q6P5Q4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LMOD2Q6P5Q4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LMOD2Q6P5Q4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
LMOD2Q6P5Q4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
LMOD2Q6P5Q4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LMOD2Q6P5Q4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LMOD2Q6P5Q4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LMOD2Q6P5Q4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
LMOD2Q6P5Q4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LMOD2Q6P5Q4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LMOD2Q6P5Q4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LMOD2Q6P5Q4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LMOD2Q6P5Q4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LMOD2Q6P5Q4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LMOD2Q6P5Q4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LMOD2Q6P5Q4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LMOD2Q6P5Q4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LMOD2Q6P5Q4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LMOD2Q6P5Q4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LMOD2Q6P5Q4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LMOD2Q6P5Q4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LMOD2Q6P5Q4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LMOD2Q6P5Q4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LMOD2Q6P5Q4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LMOD2Q6P5Q4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
LMOD2Q6P5Q4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms