Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrig3Q6P1C6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrig3Q6P1C6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrig3Q6P1C6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Lrig3Q6P1C6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrig3Q6P1C6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrig3Q6P1C6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrig3Q6P1C6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrig3Q6P1C6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrig3Q6P1C6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrig3Q6P1C6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrig3Q6P1C6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrig3Q6P1C6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrig3Q6P1C6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrig3Q6P1C6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrig3Q6P1C6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrig3Q6P1C6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrig3Q6P1C6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrig3Q6P1C6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrig3Q6P1C6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrig3Q6P1C6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrig3Q6P1C6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrig3Q6P1C6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrig3Q6P1C6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrig3Q6P1C6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrig3Q6P1C6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrig3Q6P1C6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrig3Q6P1C6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrig3Q6P1C6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrig3Q6P1C6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrig3Q6P1C6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms