Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc189Q6NZQ0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc189Q6NZQ0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc189Q6NZQ0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc189Q6NZQ0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc189Q6NZQ0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc189Q6NZQ0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc189Q6NZQ0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc189Q6NZQ0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc189Q6NZQ0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc189Q6NZQ0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc189Q6NZQ0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc189Q6NZQ0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc189Q6NZQ0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc189Q6NZQ0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc189Q6NZQ0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc189Q6NZQ0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc189Q6NZQ0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc189Q6NZQ0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc189Q6NZQ0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc189Q6NZQ0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc189Q6NZQ0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc189Q6NZQ0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc189Q6NZQ0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc189Q6NZQ0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc189Q6NZQ0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc189Q6NZQ0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc189Q6NZQ0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc189Q6NZQ0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc189Q6NZQ0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc189Q6NZQ0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc189Q6NZQ0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc189Q6NZQ0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc189Q6NZQ0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc189Q6NZQ0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc189Q6NZQ0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc189Q6NZQ0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc189Q6NZQ0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc189Q6NZQ0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc189Q6NZQ0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc189Q6NZQ0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc189Q6NZQ0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc189Q6NZQ0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc189Q6NZQ0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc189Q6NZQ0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc189Q6NZQ0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc189Q6NZQ0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms