Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP4R4Q6NUP7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP4R4Q6NUP7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms