Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
APOBEC3HQ6NTF7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
APOBEC3HQ6NTF7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
APOBEC3HQ6NTF7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
APOBEC3HQ6NTF7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
APOBEC3HQ6NTF7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
APOBEC3HQ6NTF7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
APOBEC3HQ6NTF7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
APOBEC3HQ6NTF7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
APOBEC3HQ6NTF7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
APOBEC3HQ6NTF7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
APOBEC3HQ6NTF7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
APOBEC3HQ6NTF7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
APOBEC3HQ6NTF7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
APOBEC3HQ6NTF7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
APOBEC3HQ6NTF7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
APOBEC3HQ6NTF7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
APOBEC3HQ6NTF7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
APOBEC3HQ6NTF7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
APOBEC3HQ6NTF7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
APOBEC3HQ6NTF7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
APOBEC3HQ6NTF7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
APOBEC3HQ6NTF7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
APOBEC3HQ6NTF7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
APOBEC3HQ6NTF7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
APOBEC3HQ6NTF7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
APOBEC3HQ6NTF7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
APOBEC3HQ6NTF7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
APOBEC3HQ6NTF7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
APOBEC3HQ6NTF7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
APOBEC3HQ6NTF7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
APOBEC3HQ6NTF7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
APOBEC3HQ6NTF7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
APOBEC3HQ6NTF7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
APOBEC3HQ6NTF7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
APOBEC3HQ6NTF7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
APOBEC3HQ6NTF7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
APOBEC3HQ6NTF7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
APOBEC3HQ6NTF7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
APOBEC3HQ6NTF7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
APOBEC3HQ6NTF7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
APOBEC3HQ6NTF7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
APOBEC3HQ6NTF7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms