Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg16l2Q6KAU8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg16l2Q6KAU8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg16l2Q6KAU8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg16l2Q6KAU8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg16l2Q6KAU8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg16l2Q6KAU8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg16l2Q6KAU8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg16l2Q6KAU8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg16l2Q6KAU8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg16l2Q6KAU8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg16l2Q6KAU8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg16l2Q6KAU8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg16l2Q6KAU8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg16l2Q6KAU8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg16l2Q6KAU8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg16l2Q6KAU8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg16l2Q6KAU8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg16l2Q6KAU8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg16l2Q6KAU8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg16l2Q6KAU8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg16l2Q6KAU8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg16l2Q6KAU8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg16l2Q6KAU8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg16l2Q6KAU8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg16l2Q6KAU8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg16l2Q6KAU8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg16l2Q6KAU8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg16l2Q6KAU8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg16l2Q6KAU8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg16l2Q6KAU8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg16l2Q6KAU8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg16l2Q6KAU8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg16l2Q6KAU8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg16l2Q6KAU8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atg16l2Q6KAU8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg16l2Q6KAU8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg16l2Q6KAU8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg16l2Q6KAU8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg16l2Q6KAU8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg16l2Q6KAU8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg16l2Q6KAU8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg16l2Q6KAU8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg16l2Q6KAU8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg16l2Q6KAU8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg16l2Q6KAU8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg16l2Q6KAU8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg16l2Q6KAU8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg16l2Q6KAU8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg16l2Q6KAU8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg16l2Q6KAU8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg16l2Q6KAU8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg16l2Q6KAU8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg16l2Q6KAU8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg16l2Q6KAU8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg16l2Q6KAU8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg16l2Q6KAU8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg16l2Q6KAU8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg16l2Q6KAU8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg16l2Q6KAU8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg16l2Q6KAU8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms