Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ggnbp1Q6K1E7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ggnbp1Q6K1E7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ggnbp1Q6K1E7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ggnbp1Q6K1E7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ggnbp1Q6K1E7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ggnbp1Q6K1E7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ggnbp1Q6K1E7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ggnbp1Q6K1E7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ggnbp1Q6K1E7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ggnbp1Q6K1E7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ggnbp1Q6K1E7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ggnbp1Q6K1E7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ggnbp1Q6K1E7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ggnbp1Q6K1E7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ggnbp1Q6K1E7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ggnbp1Q6K1E7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ggnbp1Q6K1E7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ggnbp1Q6K1E7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ggnbp1Q6K1E7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ggnbp1Q6K1E7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ggnbp1Q6K1E7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ggnbp1Q6K1E7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ggnbp1Q6K1E7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.9 ms