Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arhgap20Q6IFT4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arhgap20Q6IFT4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Arhgap20Q6IFT4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arhgap20Q6IFT4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arhgap20Q6IFT4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgap20Q6IFT4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgap20Q6IFT4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgap20Q6IFT4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgap20Q6IFT4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arhgap20Q6IFT4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arhgap20Q6IFT4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arhgap20Q6IFT4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arhgap20Q6IFT4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arhgap20Q6IFT4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arhgap20Q6IFT4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arhgap20Q6IFT4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arhgap20Q6IFT4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arhgap20Q6IFT4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arhgap20Q6IFT4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arhgap20Q6IFT4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arhgap20Q6IFT4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arhgap20Q6IFT4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arhgap20Q6IFT4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arhgap20Q6IFT4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Arhgap20Q6IFT4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arhgap20Q6IFT4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arhgap20Q6IFT4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arhgap20Q6IFT4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arhgap20Q6IFT4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arhgap20Q6IFT4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Arhgap20Q6IFT4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arhgap20Q6IFT4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Arhgap20Q6IFT4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arhgap20Q6IFT4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arhgap20Q6IFT4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arhgap20Q6IFT4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arhgap20Q6IFT4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arhgap20Q6IFT4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arhgap20Q6IFT4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arhgap20Q6IFT4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arhgap20Q6IFT4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arhgap20Q6IFT4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arhgap20Q6IFT4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arhgap20Q6IFT4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arhgap20Q6IFT4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Arhgap20Q6IFT4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arhgap20Q6IFT4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arhgap20Q6IFT4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arhgap20Q6IFT4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arhgap20Q6IFT4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arhgap20Q6IFT4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arhgap20Q6IFT4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arhgap20Q6IFT4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arhgap20Q6IFT4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arhgap20Q6IFT4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arhgap20Q6IFT4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arhgap20Q6IFT4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arhgap20Q6IFT4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms