Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E7

TXNRD3NB, Protein TXNRD3NB, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD3NBQ6F5E7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TXNRD3NBQ6F5E7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TXNRD3NBQ6F5E7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TXNRD3NBQ6F5E7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNRD3NBQ6F5E7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNRD3NBQ6F5E7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNRD3NBQ6F5E7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNRD3NBQ6F5E7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNRD3NBQ6F5E7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNRD3NBQ6F5E7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNRD3NBQ6F5E7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNRD3NBQ6F5E7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNRD3NBQ6F5E7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNRD3NBQ6F5E7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNRD3NBQ6F5E7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNRD3NBQ6F5E7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNRD3NBQ6F5E7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNRD3NBQ6F5E7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNRD3NBQ6F5E7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNRD3NBQ6F5E7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNRD3NBQ6F5E7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNRD3NBQ6F5E7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNRD3NBQ6F5E7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNRD3NBQ6F5E7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNRD3NBQ6F5E7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNRD3NBQ6F5E7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNRD3NBQ6F5E7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms