Protein–RNA interactions for Protein: Q6DT37

CDC42BPG, Serine/threonine-protein kinase MRCK gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42BPGQ6DT37 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDC42BPGQ6DT37 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDC42BPGQ6DT37 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDC42BPGQ6DT37 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CDC42BPGQ6DT37 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CDC42BPGQ6DT37 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CDC42BPGQ6DT37 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CDC42BPGQ6DT37 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CDC42BPGQ6DT37 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CDC42BPGQ6DT37 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CDC42BPGQ6DT37 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CDC42BPGQ6DT37 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CDC42BPGQ6DT37 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CDC42BPGQ6DT37 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CDC42BPGQ6DT37 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDC42BPGQ6DT37 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDC42BPGQ6DT37 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDC42BPGQ6DT37 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDC42BPGQ6DT37 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDC42BPGQ6DT37 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDC42BPGQ6DT37 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDC42BPGQ6DT37 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDC42BPGQ6DT37 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CDC42BPGQ6DT37 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CDC42BPGQ6DT37 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CDC42BPGQ6DT37 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CDC42BPGQ6DT37 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CDC42BPGQ6DT37 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
CDC42BPGQ6DT37 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CDC42BPGQ6DT37 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CDC42BPGQ6DT37 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CDC42BPGQ6DT37 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CDC42BPGQ6DT37 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CDC42BPGQ6DT37 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CDC42BPGQ6DT37 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CDC42BPGQ6DT37 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CDC42BPGQ6DT37 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CDC42BPGQ6DT37 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CDC42BPGQ6DT37 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CDC42BPGQ6DT37 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CDC42BPGQ6DT37 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CDC42BPGQ6DT37 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CDC42BPGQ6DT37 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDC42BPGQ6DT37 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDC42BPGQ6DT37 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDC42BPGQ6DT37 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDC42BPGQ6DT37 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDC42BPGQ6DT37 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CDC42BPGQ6DT37 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDC42BPGQ6DT37 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDC42BPGQ6DT37 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDC42BPGQ6DT37 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDC42BPGQ6DT37 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CDC42BPGQ6DT37 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CDC42BPGQ6DT37 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CDC42BPGQ6DT37 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDC42BPGQ6DT37 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDC42BPGQ6DT37 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDC42BPGQ6DT37 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDC42BPGQ6DT37 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDC42BPGQ6DT37 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDC42BPGQ6DT37 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDC42BPGQ6DT37 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDC42BPGQ6DT37 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDC42BPGQ6DT37 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDC42BPGQ6DT37 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.1 ms