Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp7Q6A4J8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Usp7Q6A4J8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Usp7Q6A4J8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Usp7Q6A4J8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Usp7Q6A4J8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Usp7Q6A4J8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Usp7Q6A4J8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp7Q6A4J8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Usp7Q6A4J8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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