Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ltn1Q6A009 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ltn1Q6A009 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ltn1Q6A009 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ltn1Q6A009 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ltn1Q6A009 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ltn1Q6A009 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ltn1Q6A009 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ltn1Q6A009 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ltn1Q6A009 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ltn1Q6A009 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ltn1Q6A009 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ltn1Q6A009 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ltn1Q6A009 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ltn1Q6A009 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ltn1Q6A009 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ltn1Q6A009 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ltn1Q6A009 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ltn1Q6A009 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ltn1Q6A009 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ltn1Q6A009 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ltn1Q6A009 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ltn1Q6A009 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ltn1Q6A009 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ltn1Q6A009 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ltn1Q6A009 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ltn1Q6A009 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ltn1Q6A009 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ltn1Q6A009 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ltn1Q6A009 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ltn1Q6A009 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ltn1Q6A009 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ltn1Q6A009 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ltn1Q6A009 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ltn1Q6A009 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ltn1Q6A009 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ltn1Q6A009 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ltn1Q6A009 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ltn1Q6A009 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ltn1Q6A009 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ltn1Q6A009 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ltn1Q6A009 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ltn1Q6A009 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ltn1Q6A009 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ltn1Q6A009 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ltn1Q6A009 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ltn1Q6A009 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ltn1Q6A009 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ltn1Q6A009 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ltn1Q6A009 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ltn1Q6A009 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ltn1Q6A009 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ltn1Q6A009 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ltn1Q6A009 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ltn1Q6A009 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ltn1Q6A009 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ltn1Q6A009 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ltn1Q6A009 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ltn1Q6A009 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ltn1Q6A009 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ltn1Q6A009 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ltn1Q6A009 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ltn1Q6A009 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ltn1Q6A009 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ltn1Q6A009 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ltn1Q6A009 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ltn1Q6A009 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ltn1Q6A009 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ltn1Q6A009 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ltn1Q6A009 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms