Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Cdk13Q69ZA1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Cdk13Q69ZA1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC31.82■■■□□ 2.69
Cdk13Q69ZA1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Cdk13Q69ZA1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Cdk13Q69ZA1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Cdk13Q69ZA1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Cdk13Q69ZA1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Cdk13Q69ZA1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Cdk13Q69ZA1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Cdk13Q69ZA1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cdk13Q69ZA1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cdk13Q69ZA1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cdk13Q69ZA1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cdk13Q69ZA1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cdk13Q69ZA1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cdk13Q69ZA1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Cdk13Q69ZA1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Cdk13Q69ZA1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Cdk13Q69ZA1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Cdk13Q69ZA1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cdk13Q69ZA1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cdk13Q69ZA1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cdk13Q69ZA1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cdk13Q69ZA1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cdk13Q69ZA1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cdk13Q69ZA1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cdk13Q69ZA1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Cdk13Q69ZA1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Cdk13Q69ZA1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Cdk13Q69ZA1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Cdk13Q69ZA1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Cdk13Q69ZA1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Cdk13Q69ZA1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Cdk13Q69ZA1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Cdk13Q69ZA1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Cdk13Q69ZA1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Cdk13Q69ZA1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cdk13Q69ZA1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cdk13Q69ZA1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Cdk13Q69ZA1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Cdk13Q69ZA1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cdk13Q69ZA1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cdk13Q69ZA1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cdk13Q69ZA1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cdk13Q69ZA1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cdk13Q69ZA1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Cdk13Q69ZA1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Cdk13Q69ZA1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Cdk13Q69ZA1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Cdk13Q69ZA1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Cdk13Q69ZA1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Cdk13Q69ZA1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Cdk13Q69ZA1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Cdk13Q69ZA1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cdk13Q69ZA1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cdk13Q69ZA1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cdk13Q69ZA1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Cdk13Q69ZA1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cdk13Q69ZA1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cdk13Q69ZA1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cdk13Q69ZA1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cdk13Q69ZA1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cdk13Q69ZA1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cdk13Q69ZA1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Cdk13Q69ZA1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cdk13Q69ZA1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cdk13Q69ZA1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Cdk13Q69ZA1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Cdk13Q69ZA1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Cdk13Q69ZA1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Cdk13Q69ZA1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cdk13Q69ZA1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cdk13Q69ZA1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Cdk13Q69ZA1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Cdk13Q69ZA1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Cdk13Q69ZA1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Cdk13Q69ZA1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cdk13Q69ZA1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cdk13Q69ZA1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Cdk13Q69ZA1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Cdk13Q69ZA1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Cdk13Q69ZA1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Cdk13Q69ZA1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Cdk13Q69ZA1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Cdk13Q69ZA1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Cdk13Q69ZA1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Cdk13Q69ZA1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Cdk13Q69ZA1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Cdk13Q69ZA1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Cdk13Q69ZA1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Cdk13Q69ZA1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Cdk13Q69ZA1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Cdk13Q69ZA1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Cdk13Q69ZA1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Cdk13Q69ZA1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Cdk13Q69ZA1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Cdk13Q69ZA1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Cdk13Q69ZA1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Cdk13Q69ZA1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms