Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Spty2d1Q68FG3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Spty2d1Q68FG3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Spty2d1Q68FG3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Spty2d1Q68FG3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Spty2d1Q68FG3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Spty2d1Q68FG3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Spty2d1Q68FG3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Spty2d1Q68FG3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Spty2d1Q68FG3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Spty2d1Q68FG3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Spty2d1Q68FG3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Spty2d1Q68FG3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Spty2d1Q68FG3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Spty2d1Q68FG3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Spty2d1Q68FG3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Spty2d1Q68FG3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Spty2d1Q68FG3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Spty2d1Q68FG3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Spty2d1Q68FG3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Spty2d1Q68FG3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Spty2d1Q68FG3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Spty2d1Q68FG3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Spty2d1Q68FG3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Spty2d1Q68FG3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Spty2d1Q68FG3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Spty2d1Q68FG3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Spty2d1Q68FG3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Spty2d1Q68FG3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Spty2d1Q68FG3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Spty2d1Q68FG3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Spty2d1Q68FG3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Spty2d1Q68FG3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Spty2d1Q68FG3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Spty2d1Q68FG3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Spty2d1Q68FG3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Spty2d1Q68FG3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.3 ms