Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScxQ64124 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScxQ64124 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScxQ64124 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScxQ64124 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScxQ64124 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScxQ64124 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ScxQ64124 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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ScxQ64124 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScxQ64124 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScxQ64124 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScxQ64124 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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ScxQ64124 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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ScxQ64124 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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ScxQ64124 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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ScxQ64124 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScxQ64124 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScxQ64124 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ScxQ64124 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ScxQ64124 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ScxQ64124 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ScxQ64124 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ScxQ64124 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ScxQ64124 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ScxQ64124 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ScxQ64124 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ScxQ64124 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ScxQ64124 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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ScxQ64124 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms