Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Sall3Q62255 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Sall3Q62255 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Sall3Q62255 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Sall3Q62255 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Sall3Q62255 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Sall3Q62255 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Sall3Q62255 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Sall3Q62255 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Sall3Q62255 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Sall3Q62255 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Sall3Q62255 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Sall3Q62255 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Sall3Q62255 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Sall3Q62255 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Sall3Q62255 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Sall3Q62255 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Sall3Q62255 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Sall3Q62255 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Sall3Q62255 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Sall3Q62255 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Sall3Q62255 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Sall3Q62255 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Sall3Q62255 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Sall3Q62255 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Sall3Q62255 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Sall3Q62255 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Sall3Q62255 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Sall3Q62255 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Sall3Q62255 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Sall3Q62255 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Sall3Q62255 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Sall3Q62255 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Sall3Q62255 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Sall3Q62255 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Sall3Q62255 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Sall3Q62255 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Sall3Q62255 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Sall3Q62255 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Sall3Q62255 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Sall3Q62255 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Sall3Q62255 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Sall3Q62255 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Sall3Q62255 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Sall3Q62255 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Sall3Q62255 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sall3Q62255 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sall3Q62255 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Sall3Q62255 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Sall3Q62255 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Sall3Q62255 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Sall3Q62255 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Sall3Q62255 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Sall3Q62255 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Sall3Q62255 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Sall3Q62255 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Sall3Q62255 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Sall3Q62255 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Sall3Q62255 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sall3Q62255 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sall3Q62255 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sall3Q62255 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sall3Q62255 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Sall3Q62255 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Sall3Q62255 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Sall3Q62255 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Sall3Q62255 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Sall3Q62255 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Sall3Q62255 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Sall3Q62255 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Sall3Q62255 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Sall3Q62255 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Sall3Q62255 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Sall3Q62255 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Sall3Q62255 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Sall3Q62255 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Sall3Q62255 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Sall3Q62255 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Sall3Q62255 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Sall3Q62255 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Sall3Q62255 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Sall3Q62255 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Sall3Q62255 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Sall3Q62255 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Sall3Q62255 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Sall3Q62255 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Sall3Q62255 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Sall3Q62255 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Sall3Q62255 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Sall3Q62255 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Sall3Q62255 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Sall3Q62255 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Sall3Q62255 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Sall3Q62255 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Sall3Q62255 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Sall3Q62255 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Sall3Q62255 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Sall3Q62255 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Sall3Q62255 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Sall3Q62255 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.6 ms