Protein–RNA interactions for Protein: Q62191

Trim21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim21Q62191 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim21Q62191 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim21Q62191 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim21Q62191 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms