Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkciQ62074 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkciQ62074 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkciQ62074 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkciQ62074 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkciQ62074 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkciQ62074 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkciQ62074 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkciQ62074 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkciQ62074 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PrkciQ62074 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkciQ62074 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkciQ62074 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkciQ62074 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkciQ62074 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkciQ62074 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkciQ62074 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkciQ62074 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkciQ62074 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkciQ62074 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkciQ62074 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkciQ62074 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkciQ62074 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkciQ62074 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkciQ62074 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkciQ62074 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkciQ62074 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms