Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Npm1Q61937 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Npm1Q61937 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Npm1Q61937 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Npm1Q61937 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Npm1Q61937 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Npm1Q61937 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Npm1Q61937 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Npm1Q61937 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Npm1Q61937 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Npm1Q61937 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Npm1Q61937 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Npm1Q61937 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Npm1Q61937 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Npm1Q61937 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Npm1Q61937 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Npm1Q61937 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Npm1Q61937 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Npm1Q61937 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Npm1Q61937 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Npm1Q61937 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Npm1Q61937 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Npm1Q61937 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
Npm1Q61937 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Npm1Q61937 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Npm1Q61937 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Npm1Q61937 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Npm1Q61937 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Npm1Q61937 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Npm1Q61937 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Npm1Q61937 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Npm1Q61937 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
Npm1Q61937 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Npm1Q61937 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Npm1Q61937 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Npm1Q61937 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Npm1Q61937 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
Npm1Q61937 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Npm1Q61937 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Npm1Q61937 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Npm1Q61937 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Npm1Q61937 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Npm1Q61937 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Npm1Q61937 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Npm1Q61937 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Npm1Q61937 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Npm1Q61937 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Npm1Q61937 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Npm1Q61937 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Npm1Q61937 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Npm1Q61937 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Npm1Q61937 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Npm1Q61937 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Npm1Q61937 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Npm1Q61937 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Npm1Q61937 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Npm1Q61937 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Npm1Q61937 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
Npm1Q61937 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Npm1Q61937 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Npm1Q61937 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
Npm1Q61937 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Npm1Q61937 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Npm1Q61937 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Npm1Q61937 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Npm1Q61937 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Npm1Q61937 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Npm1Q61937 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Npm1Q61937 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Npm1Q61937 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Npm1Q61937 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Npm1Q61937 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Npm1Q61937 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Npm1Q61937 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Npm1Q61937 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Npm1Q61937 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Npm1Q61937 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
Npm1Q61937 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Npm1Q61937 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Npm1Q61937 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Npm1Q61937 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
Npm1Q61937 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Npm1Q61937 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Npm1Q61937 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
Npm1Q61937 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Npm1Q61937 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Npm1Q61937 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Npm1Q61937 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Npm1Q61937 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Npm1Q61937 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Npm1Q61937 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Npm1Q61937 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Npm1Q61937 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Npm1Q61937 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Npm1Q61937 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Npm1Q61937 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Npm1Q61937 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Npm1Q61937 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Npm1Q61937 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Npm1Q61937 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms