Protein–RNA interactions for Protein: Q61711

Ibsp, Bone sialoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IbspQ61711 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IbspQ61711 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IbspQ61711 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IbspQ61711 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IbspQ61711 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IbspQ61711 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IbspQ61711 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IbspQ61711 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IbspQ61711 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IbspQ61711 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IbspQ61711 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IbspQ61711 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IbspQ61711 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IbspQ61711 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IbspQ61711 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IbspQ61711 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IbspQ61711 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IbspQ61711 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IbspQ61711 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IbspQ61711 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IbspQ61711 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IbspQ61711 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IbspQ61711 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IbspQ61711 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IbspQ61711 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IbspQ61711 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IbspQ61711 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IbspQ61711 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IbspQ61711 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IbspQ61711 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IbspQ61711 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IbspQ61711 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IbspQ61711 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IbspQ61711 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IbspQ61711 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IbspQ61711 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IbspQ61711 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IbspQ61711 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IbspQ61711 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IbspQ61711 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IbspQ61711 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IbspQ61711 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IbspQ61711 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IbspQ61711 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IbspQ61711 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IbspQ61711 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IbspQ61711 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IbspQ61711 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IbspQ61711 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IbspQ61711 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IbspQ61711 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IbspQ61711 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IbspQ61711 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IbspQ61711 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IbspQ61711 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IbspQ61711 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IbspQ61711 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IbspQ61711 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IbspQ61711 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IbspQ61711 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IbspQ61711 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IbspQ61711 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IbspQ61711 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms