Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ecm1Q61508 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ecm1Q61508 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ecm1Q61508 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ecm1Q61508 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ecm1Q61508 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ecm1Q61508 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ecm1Q61508 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ecm1Q61508 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ecm1Q61508 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ecm1Q61508 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ecm1Q61508 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ecm1Q61508 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ecm1Q61508 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ecm1Q61508 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ecm1Q61508 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ecm1Q61508 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ecm1Q61508 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ecm1Q61508 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ecm1Q61508 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ecm1Q61508 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ecm1Q61508 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ecm1Q61508 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ecm1Q61508 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ecm1Q61508 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ecm1Q61508 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ecm1Q61508 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ecm1Q61508 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ecm1Q61508 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ecm1Q61508 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ecm1Q61508 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ecm1Q61508 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ecm1Q61508 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ecm1Q61508 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ecm1Q61508 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ecm1Q61508 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ecm1Q61508 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ecm1Q61508 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ecm1Q61508 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ecm1Q61508 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ecm1Q61508 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ecm1Q61508 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ecm1Q61508 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ecm1Q61508 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ecm1Q61508 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ecm1Q61508 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ecm1Q61508 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ecm1Q61508 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ecm1Q61508 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ecm1Q61508 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ecm1Q61508 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ecm1Q61508 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ecm1Q61508 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ecm1Q61508 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ecm1Q61508 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ecm1Q61508 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ecm1Q61508 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ecm1Q61508 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ecm1Q61508 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ecm1Q61508 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ecm1Q61508 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ecm1Q61508 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ecm1Q61508 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ecm1Q61508 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ecm1Q61508 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ecm1Q61508 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ecm1Q61508 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ecm1Q61508 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ecm1Q61508 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ecm1Q61508 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ecm1Q61508 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ecm1Q61508 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ecm1Q61508 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ecm1Q61508 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ecm1Q61508 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ecm1Q61508 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ecm1Q61508 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ecm1Q61508 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ecm1Q61508 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ecm1Q61508 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ecm1Q61508 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ecm1Q61508 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ecm1Q61508 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ecm1Q61508 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ecm1Q61508 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ecm1Q61508 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ecm1Q61508 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ecm1Q61508 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ecm1Q61508 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ecm1Q61508 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ecm1Q61508 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ecm1Q61508 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ecm1Q61508 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ecm1Q61508 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ecm1Q61508 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ecm1Q61508 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ecm1Q61508 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ecm1Q61508 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ecm1Q61508 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ecm1Q61508 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms