Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itm2aQ61500 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itm2aQ61500 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itm2aQ61500 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itm2aQ61500 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itm2aQ61500 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itm2aQ61500 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Itm2aQ61500 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itm2aQ61500 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itm2aQ61500 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itm2aQ61500 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itm2aQ61500 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itm2aQ61500 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itm2aQ61500 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itm2aQ61500 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itm2aQ61500 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itm2aQ61500 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itm2aQ61500 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itm2aQ61500 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itm2aQ61500 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itm2aQ61500 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itm2aQ61500 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itm2aQ61500 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itm2aQ61500 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itm2aQ61500 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itm2aQ61500 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itm2aQ61500 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itm2aQ61500 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itm2aQ61500 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itm2aQ61500 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itm2aQ61500 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itm2aQ61500 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itm2aQ61500 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Itm2aQ61500 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itm2aQ61500 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itm2aQ61500 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itm2aQ61500 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itm2aQ61500 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itm2aQ61500 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itm2aQ61500 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itm2aQ61500 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itm2aQ61500 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itm2aQ61500 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itm2aQ61500 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itm2aQ61500 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itm2aQ61500 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itm2aQ61500 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Itm2aQ61500 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itm2aQ61500 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itm2aQ61500 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itm2aQ61500 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itm2aQ61500 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itm2aQ61500 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itm2aQ61500 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Itm2aQ61500 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itm2aQ61500 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itm2aQ61500 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itm2aQ61500 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itm2aQ61500 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itm2aQ61500 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itm2aQ61500 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itm2aQ61500 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itm2aQ61500 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itm2aQ61500 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itm2aQ61500 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms