Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Foxd1Q61345 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Foxd1Q61345 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Foxd1Q61345 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Foxd1Q61345 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Foxd1Q61345 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Foxd1Q61345 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Foxd1Q61345 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Foxd1Q61345 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Foxd1Q61345 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Foxd1Q61345 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Foxd1Q61345 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Foxd1Q61345 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Foxd1Q61345 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Foxd1Q61345 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Foxd1Q61345 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Foxd1Q61345 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Foxd1Q61345 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Foxd1Q61345 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Foxd1Q61345 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Foxd1Q61345 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Foxd1Q61345 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Foxd1Q61345 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Foxd1Q61345 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Foxd1Q61345 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Foxd1Q61345 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Foxd1Q61345 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Foxd1Q61345 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Foxd1Q61345 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Foxd1Q61345 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Foxd1Q61345 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Foxd1Q61345 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Foxd1Q61345 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Foxd1Q61345 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Foxd1Q61345 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Foxd1Q61345 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Foxd1Q61345 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Foxd1Q61345 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Foxd1Q61345 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Foxd1Q61345 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Foxd1Q61345 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Foxd1Q61345 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Foxd1Q61345 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Foxd1Q61345 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Foxd1Q61345 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Foxd1Q61345 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Foxd1Q61345 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Foxd1Q61345 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Foxd1Q61345 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Foxd1Q61345 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Foxd1Q61345 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Foxd1Q61345 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Foxd1Q61345 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Foxd1Q61345 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Foxd1Q61345 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Foxd1Q61345 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Foxd1Q61345 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Foxd1Q61345 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Foxd1Q61345 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Foxd1Q61345 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Foxd1Q61345 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Foxd1Q61345 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Foxd1Q61345 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Foxd1Q61345 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Foxd1Q61345 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Foxd1Q61345 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Foxd1Q61345 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Foxd1Q61345 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Foxd1Q61345 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Foxd1Q61345 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Foxd1Q61345 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms