Protein–RNA interactions for Protein: Q61233

Lcp1, Plastin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcp1Q61233 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lcp1Q61233 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lcp1Q61233 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lcp1Q61233 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lcp1Q61233 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lcp1Q61233 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lcp1Q61233 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lcp1Q61233 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lcp1Q61233 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lcp1Q61233 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lcp1Q61233 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lcp1Q61233 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lcp1Q61233 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lcp1Q61233 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lcp1Q61233 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lcp1Q61233 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lcp1Q61233 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lcp1Q61233 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lcp1Q61233 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lcp1Q61233 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lcp1Q61233 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lcp1Q61233 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lcp1Q61233 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lcp1Q61233 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lcp1Q61233 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lcp1Q61233 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lcp1Q61233 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lcp1Q61233 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lcp1Q61233 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lcp1Q61233 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lcp1Q61233 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lcp1Q61233 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lcp1Q61233 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lcp1Q61233 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lcp1Q61233 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lcp1Q61233 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lcp1Q61233 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lcp1Q61233 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lcp1Q61233 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lcp1Q61233 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lcp1Q61233 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lcp1Q61233 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lcp1Q61233 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lcp1Q61233 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lcp1Q61233 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lcp1Q61233 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lcp1Q61233 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lcp1Q61233 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lcp1Q61233 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lcp1Q61233 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms