Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Prpf4bQ61136 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prpf4bQ61136 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prpf4bQ61136 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpf4bQ61136 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpf4bQ61136 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpf4bQ61136 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpf4bQ61136 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpf4bQ61136 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpf4bQ61136 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpf4bQ61136 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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