Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cln3Q61124 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cln3Q61124 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cln3Q61124 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cln3Q61124 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cln3Q61124 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cln3Q61124 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cln3Q61124 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cln3Q61124 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cln3Q61124 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cln3Q61124 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cln3Q61124 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cln3Q61124 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cln3Q61124 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cln3Q61124 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cln3Q61124 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cln3Q61124 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cln3Q61124 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cln3Q61124 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cln3Q61124 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cln3Q61124 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cln3Q61124 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cln3Q61124 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cln3Q61124 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cln3Q61124 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cln3Q61124 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cln3Q61124 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cln3Q61124 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cln3Q61124 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cln3Q61124 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cln3Q61124 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cln3Q61124 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cln3Q61124 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cln3Q61124 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cln3Q61124 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cln3Q61124 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cln3Q61124 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cln3Q61124 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cln3Q61124 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cln3Q61124 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cln3Q61124 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cln3Q61124 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cln3Q61124 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cln3Q61124 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cln3Q61124 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cln3Q61124 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cln3Q61124 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cln3Q61124 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cln3Q61124 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cln3Q61124 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cln3Q61124 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cln3Q61124 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cln3Q61124 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cln3Q61124 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cln3Q61124 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cln3Q61124 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cln3Q61124 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cln3Q61124 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cln3Q61124 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cln3Q61124 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cln3Q61124 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cln3Q61124 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cln3Q61124 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cln3Q61124 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cln3Q61124 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cln3Q61124 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cln3Q61124 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cln3Q61124 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cln3Q61124 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cln3Q61124 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cln3Q61124 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cln3Q61124 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cln3Q61124 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cln3Q61124 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cln3Q61124 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cln3Q61124 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cln3Q61124 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cln3Q61124 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cln3Q61124 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cln3Q61124 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cln3Q61124 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cln3Q61124 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cln3Q61124 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cln3Q61124 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cln3Q61124 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cln3Q61124 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cln3Q61124 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cln3Q61124 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cln3Q61124 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cln3Q61124 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cln3Q61124 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cln3Q61124 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cln3Q61124 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cln3Q61124 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cln3Q61124 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cln3Q61124 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cln3Q61124 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cln3Q61124 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cln3Q61124 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cln3Q61124 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms