Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc1Q61056 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc1Q61056 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc1Q61056 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc1Q61056 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc1Q61056 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc1Q61056 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc1Q61056 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc1Q61056 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc1Q61056 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc1Q61056 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc1Q61056 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc1Q61056 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc1Q61056 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc1Q61056 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc1Q61056 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc1Q61056 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc1Q61056 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc1Q61056 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc1Q61056 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc1Q61056 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc1Q61056 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc1Q61056 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpc1Q61056 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpc1Q61056 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpc1Q61056 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc1Q61056 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc1Q61056 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc1Q61056 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trpc1Q61056 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc1Q61056 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc1Q61056 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc1Q61056 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc1Q61056 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc1Q61056 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc1Q61056 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc1Q61056 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc1Q61056 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc1Q61056 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc1Q61056 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc1Q61056 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc1Q61056 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc1Q61056 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc1Q61056 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc1Q61056 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc1Q61056 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc1Q61056 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc1Q61056 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc1Q61056 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc1Q61056 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc1Q61056 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc1Q61056 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc1Q61056 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc1Q61056 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms