Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd6Q61003 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd6Q61003 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd6Q61003 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd6Q61003 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd6Q61003 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cd6Q61003 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cd6Q61003 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd6Q61003 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd6Q61003 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd6Q61003 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd6Q61003 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd6Q61003 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd6Q61003 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd6Q61003 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd6Q61003 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd6Q61003 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd6Q61003 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd6Q61003 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd6Q61003 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd6Q61003 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd6Q61003 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd6Q61003 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd6Q61003 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd6Q61003 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd6Q61003 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd6Q61003 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd6Q61003 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd6Q61003 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd6Q61003 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd6Q61003 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd6Q61003 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd6Q61003 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd6Q61003 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd6Q61003 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd6Q61003 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd6Q61003 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd6Q61003 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd6Q61003 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd6Q61003 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd6Q61003 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd6Q61003 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd6Q61003 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd6Q61003 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd6Q61003 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd6Q61003 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd6Q61003 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd6Q61003 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd6Q61003 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd6Q61003 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd6Q61003 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd6Q61003 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd6Q61003 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd6Q61003 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd6Q61003 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd6Q61003 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd6Q61003 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd6Q61003 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd6Q61003 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd6Q61003 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd6Q61003 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd6Q61003 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd6Q61003 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd6Q61003 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd6Q61003 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms