Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Foxg1Q60987 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxg1Q60987 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Foxg1Q60987 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxg1Q60987 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.7 ms