Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klf3Q60980 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klf3Q60980 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf3Q60980 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms