Protein–RNA interactions for Protein: Q60931

Vdac3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac3Q60931 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vdac3Q60931 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vdac3Q60931 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vdac3Q60931 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vdac3Q60931 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vdac3Q60931 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vdac3Q60931 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vdac3Q60931 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vdac3Q60931 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vdac3Q60931 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vdac3Q60931 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vdac3Q60931 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Vdac3Q60931 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Vdac3Q60931 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vdac3Q60931 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vdac3Q60931 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vdac3Q60931 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vdac3Q60931 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vdac3Q60931 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vdac3Q60931 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vdac3Q60931 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vdac3Q60931 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vdac3Q60931 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vdac3Q60931 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms