Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Epha1Q60750 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.1 ms