Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Samhd1Q60710 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Samhd1Q60710 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Samhd1Q60710 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Samhd1Q60710 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Samhd1Q60710 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Samhd1Q60710 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Samhd1Q60710 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Samhd1Q60710 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Samhd1Q60710 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Samhd1Q60710 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Samhd1Q60710 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Samhd1Q60710 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Samhd1Q60710 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Samhd1Q60710 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Samhd1Q60710 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Samhd1Q60710 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Samhd1Q60710 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Samhd1Q60710 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Samhd1Q60710 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Samhd1Q60710 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Samhd1Q60710 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Samhd1Q60710 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Samhd1Q60710 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Samhd1Q60710 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Samhd1Q60710 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Samhd1Q60710 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Samhd1Q60710 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Samhd1Q60710 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Samhd1Q60710 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Samhd1Q60710 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Samhd1Q60710 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Samhd1Q60710 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Samhd1Q60710 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Samhd1Q60710 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Samhd1Q60710 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Samhd1Q60710 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Samhd1Q60710 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Samhd1Q60710 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Samhd1Q60710 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Samhd1Q60710 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Samhd1Q60710 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Samhd1Q60710 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Samhd1Q60710 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Samhd1Q60710 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Samhd1Q60710 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Samhd1Q60710 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Samhd1Q60710 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Samhd1Q60710 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Samhd1Q60710 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Samhd1Q60710 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Samhd1Q60710 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Samhd1Q60710 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Samhd1Q60710 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Samhd1Q60710 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Samhd1Q60710 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Samhd1Q60710 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Samhd1Q60710 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Samhd1Q60710 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Samhd1Q60710 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Samhd1Q60710 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Samhd1Q60710 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Samhd1Q60710 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Samhd1Q60710 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Samhd1Q60710 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms