Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Sin3aQ60520 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Sin3aQ60520 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Sin3aQ60520 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Sin3aQ60520 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Sin3aQ60520 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Sin3aQ60520 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Sin3aQ60520 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Sin3aQ60520 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sin3aQ60520 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Sin3aQ60520 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Sin3aQ60520 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Sin3aQ60520 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Sin3aQ60520 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Sin3aQ60520 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Sin3aQ60520 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Sin3aQ60520 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Sin3aQ60520 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Sin3aQ60520 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Sin3aQ60520 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Sin3aQ60520 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Sin3aQ60520 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Sin3aQ60520 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Sin3aQ60520 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Sin3aQ60520 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Sin3aQ60520 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Sin3aQ60520 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Sin3aQ60520 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Sin3aQ60520 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Sin3aQ60520 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Sin3aQ60520 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Sin3aQ60520 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Sin3aQ60520 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Sin3aQ60520 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Sin3aQ60520 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Sin3aQ60520 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Sin3aQ60520 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Sin3aQ60520 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Sin3aQ60520 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Sin3aQ60520 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Sin3aQ60520 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Sin3aQ60520 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Sin3aQ60520 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Sin3aQ60520 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Sin3aQ60520 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Sin3aQ60520 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Sin3aQ60520 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Sin3aQ60520 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Sin3aQ60520 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Sin3aQ60520 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Sin3aQ60520 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Sin3aQ60520 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Sin3aQ60520 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
Sin3aQ60520 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Sin3aQ60520 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Sin3aQ60520 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Sin3aQ60520 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Sin3aQ60520 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Sin3aQ60520 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Sin3aQ60520 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Sin3aQ60520 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Sin3aQ60520 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Sin3aQ60520 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Sin3aQ60520 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Sin3aQ60520 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Sin3aQ60520 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Sin3aQ60520 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Sin3aQ60520 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms