Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF90

Atp13a4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a4Q5XF90 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp13a4Q5XF90 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp13a4Q5XF90 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp13a4Q5XF90 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp13a4Q5XF90 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp13a4Q5XF90 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp13a4Q5XF90 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp13a4Q5XF90 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp13a4Q5XF90 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp13a4Q5XF90 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp13a4Q5XF90 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp13a4Q5XF90 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp13a4Q5XF90 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp13a4Q5XF90 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp13a4Q5XF90 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp13a4Q5XF90 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp13a4Q5XF90 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp13a4Q5XF90 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms