Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp13a3Q5XF89 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp13a3Q5XF89 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp13a3Q5XF89 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp13a3Q5XF89 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp13a3Q5XF89 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp13a3Q5XF89 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp13a3Q5XF89 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp13a3Q5XF89 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp13a3Q5XF89 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp13a3Q5XF89 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp13a3Q5XF89 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp13a3Q5XF89 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp13a3Q5XF89 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp13a3Q5XF89 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp13a3Q5XF89 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp13a3Q5XF89 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp13a3Q5XF89 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Atp13a3Q5XF89 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp13a3Q5XF89 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp13a3Q5XF89 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp13a3Q5XF89 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp13a3Q5XF89 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp13a3Q5XF89 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp13a3Q5XF89 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp13a3Q5XF89 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp13a3Q5XF89 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp13a3Q5XF89 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp13a3Q5XF89 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp13a3Q5XF89 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp13a3Q5XF89 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp13a3Q5XF89 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp13a3Q5XF89 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp13a3Q5XF89 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp13a3Q5XF89 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp13a3Q5XF89 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp13a3Q5XF89 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp13a3Q5XF89 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp13a3Q5XF89 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp13a3Q5XF89 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp13a3Q5XF89 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp13a3Q5XF89 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp13a3Q5XF89 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp13a3Q5XF89 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp13a3Q5XF89 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp13a3Q5XF89 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp13a3Q5XF89 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp13a3Q5XF89 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp13a3Q5XF89 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp13a3Q5XF89 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp13a3Q5XF89 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp13a3Q5XF89 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp13a3Q5XF89 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp13a3Q5XF89 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp13a3Q5XF89 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp13a3Q5XF89 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp13a3Q5XF89 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp13a3Q5XF89 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp13a3Q5XF89 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp13a3Q5XF89 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp13a3Q5XF89 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp13a3Q5XF89 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atp13a3Q5XF89 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp13a3Q5XF89 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp13a3Q5XF89 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp13a3Q5XF89 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.3 ms