Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGAP9Q5VTM2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGAP9Q5VTM2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGAP9Q5VTM2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGAP9Q5VTM2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGAP9Q5VTM2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGAP9Q5VTM2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP9Q5VTM2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP9Q5VTM2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP9Q5VTM2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP9Q5VTM2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP9Q5VTM2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP9Q5VTM2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGAP9Q5VTM2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGAP9Q5VTM2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGAP9Q5VTM2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGAP9Q5VTM2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGAP9Q5VTM2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGAP9Q5VTM2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGAP9Q5VTM2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
AGAP9Q5VTM2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGAP9Q5VTM2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGAP9Q5VTM2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGAP9Q5VTM2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
AGAP9Q5VTM2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGAP9Q5VTM2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms