Protein–RNA interactions for Protein: Q5TZA2

CROCC, Rootletin, humanhuman

Predictions only

Length 2,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCQ5TZA2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CROCCQ5TZA2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CROCCQ5TZA2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms