Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC37.08■■■■□ 3.53
RSPH4AQ5TD94 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
RSPH4AQ5TD94 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
RSPH4AQ5TD94 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
RSPH4AQ5TD94 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
RSPH4AQ5TD94 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.52
RSPH4AQ5TD94 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
RSPH4AQ5TD94 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
RSPH4AQ5TD94 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
RSPH4AQ5TD94 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
RSPH4AQ5TD94 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
RSPH4AQ5TD94 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
RSPH4AQ5TD94 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
RSPH4AQ5TD94 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
RSPH4AQ5TD94 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
RSPH4AQ5TD94 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RSPH4AQ5TD94 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RSPH4AQ5TD94 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RSPH4AQ5TD94 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RSPH4AQ5TD94 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
RSPH4AQ5TD94 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
RSPH4AQ5TD94 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
RSPH4AQ5TD94 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
RSPH4AQ5TD94 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
RSPH4AQ5TD94 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
RSPH4AQ5TD94 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
RSPH4AQ5TD94 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
RSPH4AQ5TD94 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
RSPH4AQ5TD94 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
RSPH4AQ5TD94 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
RSPH4AQ5TD94 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37■■■■□ 3.51
RSPH4AQ5TD94 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
RSPH4AQ5TD94 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
RSPH4AQ5TD94 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
RSPH4AQ5TD94 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
RSPH4AQ5TD94 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
RSPH4AQ5TD94 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
RSPH4AQ5TD94 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
RSPH4AQ5TD94 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
RSPH4AQ5TD94 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
RSPH4AQ5TD94 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
RSPH4AQ5TD94 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
RSPH4AQ5TD94 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RSPH4AQ5TD94 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
RSPH4AQ5TD94 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
RSPH4AQ5TD94 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
RSPH4AQ5TD94 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
RSPH4AQ5TD94 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
RSPH4AQ5TD94 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
RSPH4AQ5TD94 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
RSPH4AQ5TD94 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
RSPH4AQ5TD94 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
RSPH4AQ5TD94 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
RSPH4AQ5TD94 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
RSPH4AQ5TD94 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
RSPH4AQ5TD94 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
RSPH4AQ5TD94 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
RSPH4AQ5TD94 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
RSPH4AQ5TD94 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
RSPH4AQ5TD94 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
RSPH4AQ5TD94 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
RSPH4AQ5TD94 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
RSPH4AQ5TD94 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
RSPH4AQ5TD94 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
RSPH4AQ5TD94 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
RSPH4AQ5TD94 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
RSPH4AQ5TD94 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
RSPH4AQ5TD94 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
RSPH4AQ5TD94 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
RSPH4AQ5TD94 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
RSPH4AQ5TD94 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
RSPH4AQ5TD94 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
RSPH4AQ5TD94 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
RSPH4AQ5TD94 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
RSPH4AQ5TD94 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
RSPH4AQ5TD94 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
RSPH4AQ5TD94 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
RSPH4AQ5TD94 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.88■■■■□ 3.49
RSPH4AQ5TD94 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
RSPH4AQ5TD94 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
RSPH4AQ5TD94 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
RSPH4AQ5TD94 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
RSPH4AQ5TD94 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
RSPH4AQ5TD94 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
RSPH4AQ5TD94 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
RSPH4AQ5TD94 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
RSPH4AQ5TD94 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RSPH4AQ5TD94 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
RSPH4AQ5TD94 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
RSPH4AQ5TD94 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
RSPH4AQ5TD94 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RSPH4AQ5TD94 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
RSPH4AQ5TD94 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
RSPH4AQ5TD94 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RSPH4AQ5TD94 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
RSPH4AQ5TD94 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RSPH4AQ5TD94 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RSPH4AQ5TD94 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
RSPH4AQ5TD94 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
RSPH4AQ5TD94 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms