Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBAP2Q5T6F2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBAP2Q5T6F2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBAP2Q5T6F2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBAP2Q5T6F2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBAP2Q5T6F2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBAP2Q5T6F2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBAP2Q5T6F2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBAP2Q5T6F2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBAP2Q5T6F2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBAP2Q5T6F2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBAP2Q5T6F2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBAP2Q5T6F2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBAP2Q5T6F2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBAP2Q5T6F2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBAP2Q5T6F2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBAP2Q5T6F2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBAP2Q5T6F2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBAP2Q5T6F2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
UBAP2Q5T6F2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBAP2Q5T6F2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBAP2Q5T6F2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms