Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms