Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ankrd40Q5SUE8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ankrd40Q5SUE8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ankrd40Q5SUE8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ankrd40Q5SUE8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ankrd40Q5SUE8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ankrd40Q5SUE8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ankrd40Q5SUE8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ankrd40Q5SUE8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ankrd40Q5SUE8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ankrd40Q5SUE8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ankrd40Q5SUE8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ankrd40Q5SUE8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ankrd40Q5SUE8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ankrd40Q5SUE8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ankrd40Q5SUE8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ankrd40Q5SUE8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ankrd40Q5SUE8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ankrd40Q5SUE8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ankrd40Q5SUE8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ankrd40Q5SUE8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ankrd40Q5SUE8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ankrd40Q5SUE8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ankrd40Q5SUE8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ankrd40Q5SUE8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ankrd40Q5SUE8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ankrd40Q5SUE8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ankrd40Q5SUE8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ankrd40Q5SUE8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.7 ms