Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgap44Q5SSM3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arhgap44Q5SSM3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arhgap44Q5SSM3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arhgap44Q5SSM3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arhgap44Q5SSM3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arhgap44Q5SSM3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arhgap44Q5SSM3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arhgap44Q5SSM3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arhgap44Q5SSM3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arhgap44Q5SSM3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arhgap44Q5SSM3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arhgap44Q5SSM3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arhgap44Q5SSM3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arhgap44Q5SSM3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arhgap44Q5SSM3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arhgap44Q5SSM3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arhgap44Q5SSM3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arhgap44Q5SSM3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgap44Q5SSM3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgap44Q5SSM3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgap44Q5SSM3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgap44Q5SSM3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arhgap44Q5SSM3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.1 ms