Protein–RNA interactions for Protein: Q5RL73

RBM48, RNA-binding protein 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM48Q5RL73 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM48Q5RL73 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM48Q5RL73 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM48Q5RL73 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM48Q5RL73 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM48Q5RL73 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM48Q5RL73 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBM48Q5RL73 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms