Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rapgef6Q5NCJ1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rapgef6Q5NCJ1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Rapgef6Q5NCJ1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rapgef6Q5NCJ1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rapgef6Q5NCJ1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rapgef6Q5NCJ1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Rapgef6Q5NCJ1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rapgef6Q5NCJ1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rapgef6Q5NCJ1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rapgef6Q5NCJ1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rapgef6Q5NCJ1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rapgef6Q5NCJ1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rapgef6Q5NCJ1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rapgef6Q5NCJ1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Rapgef6Q5NCJ1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rapgef6Q5NCJ1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rapgef6Q5NCJ1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rapgef6Q5NCJ1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rapgef6Q5NCJ1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rapgef6Q5NCJ1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rapgef6Q5NCJ1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rapgef6Q5NCJ1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rapgef6Q5NCJ1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rapgef6Q5NCJ1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rapgef6Q5NCJ1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rapgef6Q5NCJ1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rapgef6Q5NCJ1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rapgef6Q5NCJ1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rapgef6Q5NCJ1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rapgef6Q5NCJ1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rapgef6Q5NCJ1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rapgef6Q5NCJ1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rapgef6Q5NCJ1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Rapgef6Q5NCJ1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rapgef6Q5NCJ1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Rapgef6Q5NCJ1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Rapgef6Q5NCJ1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Rapgef6Q5NCJ1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Rapgef6Q5NCJ1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Rapgef6Q5NCJ1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Rapgef6Q5NCJ1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rapgef6Q5NCJ1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rapgef6Q5NCJ1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rapgef6Q5NCJ1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rapgef6Q5NCJ1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rapgef6Q5NCJ1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rapgef6Q5NCJ1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rapgef6Q5NCJ1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rapgef6Q5NCJ1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rapgef6Q5NCJ1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rapgef6Q5NCJ1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rapgef6Q5NCJ1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rapgef6Q5NCJ1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rapgef6Q5NCJ1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rapgef6Q5NCJ1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rapgef6Q5NCJ1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rapgef6Q5NCJ1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rapgef6Q5NCJ1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rapgef6Q5NCJ1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rapgef6Q5NCJ1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rapgef6Q5NCJ1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rapgef6Q5NCJ1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rapgef6Q5NCJ1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Rapgef6Q5NCJ1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rapgef6Q5NCJ1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rapgef6Q5NCJ1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rapgef6Q5NCJ1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rapgef6Q5NCJ1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rapgef6Q5NCJ1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Rapgef6Q5NCJ1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Rapgef6Q5NCJ1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rapgef6Q5NCJ1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rapgef6Q5NCJ1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rapgef6Q5NCJ1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rapgef6Q5NCJ1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rapgef6Q5NCJ1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rapgef6Q5NCJ1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rapgef6Q5NCJ1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rapgef6Q5NCJ1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rapgef6Q5NCJ1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rapgef6Q5NCJ1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rapgef6Q5NCJ1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rapgef6Q5NCJ1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rapgef6Q5NCJ1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rapgef6Q5NCJ1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rapgef6Q5NCJ1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rapgef6Q5NCJ1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms