Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C3orf38Q5JPI3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C3orf38Q5JPI3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf38Q5JPI3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf38Q5JPI3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms