Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E8

ZC3H12A, Endoribonuclease ZC3H12A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12AQ5D1E8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZC3H12AQ5D1E8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZC3H12AQ5D1E8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZC3H12AQ5D1E8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZC3H12AQ5D1E8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZC3H12AQ5D1E8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZC3H12AQ5D1E8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms